O currículo do curso de Mestrado em Educação organiza-se em dois momentos que antecedem o trabalho final de dissertação. O primeiro, de caráter obrigatório e que precede todas as demais atividades, volta-se para a reflexão crítica das práticas individuais dos alunos, usando como material didático o próprio projeto de trabalho apresentado pelos candidatos no ato da inscrição. No segundo momento, os alunos reunidos em grupos constituídos de acordo com os temas de pesquisa, e orientados por professores, elaboram os projetos das dissertações, definem os programas de estudo, cursam disciplinas e envolvem-se em atividades.
A duração do curso de Mestrado é de no mínimo um ano e no máximo dois anos e meio, exigindo-se a integralização de vinte e quatro créditos, a comprovação de uma Produção Acadêmica de Pós-Graduação e a defesa da dissertação.